El Ministro de Defensa, Fernando “Corcho” Cordero renunció a su cargo, luego de la serie de diferencias que surgieron entre el gobierno y las Fuerzas Armadas, como consecuencia del retiro de 41 millones de dólares de fondos del ISSFA.
El ex Secretario de Estado, quien se mantenía con el gobierno desde que era Presidente de la Asamblea Constituyente y luego Presidente del IESS, fue declarado persona no grata por los militares retirados.
Presidió la Comisión Legislativa y de Fiscalización, en el período de transición (octubre 2008-julio 2009). El 26 de abril de 2009, con 2.260.672 votos, fue elegido como asambleísta nacional y el 31 de julio de 2009, como presidente de la Asamblea Nacional.
El 31 de julio de 2011 fue elegido, por mayoría absoluta, presidente de la Asamblea Nacional para el período 2011 – 2013
El 26 de abril de 2013 presentó su renuncia al cargo para asumir como presidente del consejo directivo del IESS, designado por el presidente de la república.
Fue Ministro de Defensa Nacional de la República del Ecuador ( 26 de septiembre de 2014 – 1 de marzo de 2016).
Cordero antes de irse, deja dos acuerdos ministeriales para que los oficiales y tropa sean designados en base a sus méritos, se establece un sistema unificado de reclutamiento de oficiales y tropa, para que sean asignados por puntaje y el otro dispone que los oficiales y personal de tropa compartan comedores, baños y accesos en las unidades militares.
